Segeåns avrinningsområde ligger i sydvästra Skåne. Större sjöar är
Börringesjön, Yddingesjön, Fjällfotasjön, och Havgårdssjön. Segeåns
avrinningsområde omfattar totalt 335 km², varav Torrebergabäckens
tillrinningsområde i norr utgör 73 km², Spångholmsbäckens, som
avvattnar Yddingesjön, utgör 45 km² och Risebergabäcken i väster
avvattnar ca 30 km².
Avrinningsområdet präglas av jordbruksmark. Skog och mer
extensivt brukade marker finns framför allt i områdena runt sjöarna
i den sydöstra delen av avrinningsområdet. I de västra delarna nära
åns utlopp i Öresund passerar ån genom Malmö och Burlövs kommuner
där marken huvudsakligen är bebyggd. Intensivt odlade delar finner
man längs åns huvudfåra från nedströms Svedala till Malmö tätort,
samt i de nedre delarna av Torrebergabäcken och Spångholmsbäcken.
Segeåns huvudfåra är ca 4,6 mil från Börringesjön till Öresund och
har ett relativt lugnt lopp med få strömsträckor. Strömpartier
finns i huvudfåran vid Skabersjö och Lilla Mölleberga, samt på
vissa sträckor av Torrebergabäcken, Spångholmsbäcken och
Risebergabäcken. Ett annat utmärkande drag för Sege å är att
vattnet är grumligt, vilket det ibland kan vara hela sträckan till
Öresund. Särskilt sträckan från Börringesjön fram till nedströms
Svedala uppvisar ofta höga grumlighetsvärden, vilket hänger samman
med tillflödande diken som avvattnar leriga områden.