La Universidad de Guanajuato data del siglo XVIII; tuvo su origen en el Hospicio de la Santísima Trinidad, instalado el día primero de octubre de 1732, en la que fuera casa habitación de su promotora y auspiciante, Doña Josefa Teresa de Busto y Moya.
Después, la institución sufre varias transformaciones: en el año de 1744, la Corona de España concedió licencia para que el Hospicio pasara a ser Colegio de la Santísima Trinidad, en donde se impartieron cursos de artes y cátedras de gramática.
Con el primer gobierno constitucional, el 29 de agosto de 1827 el plantel cambió su denominación a Colegio de la Purísima Concepción; en este periodo se fundaron las carreras de Minería y Derecho Laico, conservando la carrera eclesiástica y una academia de pintura, escultura y arquitectura. El Colegio contó con biblioteca pública desde 1831.
En 1870, la institución se denominó como el Colegio del Estado de Guanajuato. En el lapso de 1870 a 1882 proliferan las carreras técnicas y científicas y florece la investigación.
En el año de 1945, el Licenciado Armando Olivares Carrillo, último Director del Colegio del Estado, promovió la transformación a Universidad de Guanajuato.
El 11 de mayo de 1994, la LV Legislatura del Congreso del Estado aprobó la autonomía de la Universidad de Guanajuato, con ello puede elegir a su rector.
La institución es autónoma, pero conserva su nombre original.
La Universidad de Guanajuato en 2008 se transformó en un sistema multicampus y cuenta actualmente con cuatro campi en el estado: Celaya-Salvatierra, Guanajuato, Irapuato-Salamanca y León. En todos ellos se ofrecen diferentes licenciaturas y posgrados. También cuenta con 10 escuelas de nivel medio superior o preparatoria.
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