La iglesia se concluyó en el año 1257 y posteriormente fue atendida por la Cofradía de Nuestra Señora de Rocamador. Como era costumbre de esta cofradía, junto a ella, en la parte izquierda y ya cerca del arroyo del Zurguén, se construyó un albergue-hospital, para atender a los peregrinos que llegaban cansados o heridos después de caminar por el Camino Mozárabe a Santiago, ahora llamado también Vía de la Plata.

La pequeña iglesia ha sido reconstruida en varias ocasiones, principalmente como consecuencia de las crecidas del río Tormes. La mayor de todas fue la del 26 de enero de 1616, día de San Policarpo, y la más reciente, a principios del siglo XX.

Siglos después el albergue-hospital fue convertido en viviendas, hasta hace pocos años, que fue derruido, quedando sólo la iglesia, que actualmente ha quedado rodeada por edificios de nueva construcción, separados de ella por escasos metros.

La iglesia ha estado abandonada y en ruinas durante 56 años, para terminar, el templo fue abierto al culto el día 23 de diciembre del año 2006. 

Por fuentes ligadas al Archivo de Salamanca, se sabe que la imagen fue vendida por 20.000 pesetas por don Ramón, en aquel entonces sacerdote encargado del templo, a un miembro de la familia Cobaleda, que también era propietario de la Casa de las Muertes. Posteriormente fue revendida por este señor, junto a otras obras de arte que tenía, en Madrid. A partir de ahí se ha perdido toda referencia sobre el paradero de la imagen de Nuestra Señora de Rocamador.

Dado el lamentable estado de la iglesia, el 7 de julio de 1947 comenzó a construirse otra nueva a muy pocos metros de distancia de la antigua. Después de un periodo de tiempo en que quedó paralizada la obra, por fin quedó terminada la iglesia nueva. El día 7 de diciembre de 1959 fueron entregadas las llaves. El momento culmen fue el día 6 de marzo de 1960, que fue inaugurada por el entonces Obispo de la Diócesis de Salamanca Francisco Barbado Viejo.

Aquí hago referencia a unos fragmentos de un interesantísimo artículo de Jesús Málaga : 

Pertenecía a la encomienda de San Juan de Barbalos y posiblemente se fundó una vez repoblada Salamanca por Raimundo de Borgoña, en el siglo XII o a principios del siglo XIII. De lo que sí estamos seguros es que reinando Alfonso X la ermita de la virgen de Rocamador era un santuario famoso en el reino, ya que el monarca la cita en su Libro de las Siete Partidas.

El nombre de la Virgen procede de una pequeña localidad francesa, Rocamadour, situada en el departamento de Lot. Esta población conoció en la edad media una abadía dedicada a una imagen negra de Nôtre Dame de Rocamadour, construida, según la leyenda, por un ermitaño servidor de la virgen.

(...) El hospital, situado al lado de la iglesia, atendía a los pobres peregrinos que pasaban por la ciudad a través de la Calzada de la Plata, por el llamado camino Mozárabe a Santiago. De esta ruta, en el tramo cercano al puente romano, solamente nos quedan restos desde Aldeatejada hasta la vía del ferrocarril Salamanca-Fuentes de Oñoro”.

(...) Los peregrinos cristianos que se dirigían a Santiago de Compostela desde el sur de la península, cuando estaba ocupada por los reinos sarracenos, descansaban y eran curados de los males contraídos en el camino en este hospital, cuya fama debió de ser mucha si hacemos caso a los componentes de la cofradía que lo atendía y a la gran cantidad de benefactores atraídos por la milagrosa imagen de la Virgen de Rocamador, venerada en la ermita adjunta al hospital.