Najvyšším vrcholom Národnej prírodnej rezervácie je Skalná Alpa (1463,2 m.n.m.) a je jedným z mála trosiek Chočského príkrovu, ktorý vystupuje na prevažne hôľnatom Hrebeni Veľkej Fatry. NPR sa nachádza v 5. stupni ochrany a malá časť Skalnej Alpy v rámci NP Veľká Fatra v 3. stupni ochrany.
Skalná Alpa. V popredí vrchol Tanečnica. (fotené 2.8.2014 z Rakytova)
Skalná Alpa. Na pravo vrchol Tanečnica. (fotené 12.12.2013 z Rakytova)
Porasty pralesovitého charakteru tvoria enklávy medzi obhospodarovanými lesmi a sekundárnymi hoľami približne v rozmedzí nadmorských výšok od 950 do 1 420 (juhovýchodné svahy Skalnej alpy). V závislosti od typu biotopu dominuje v pralese buk (bukové a jedľovo-bukové kvetnaté lesy, vápnomilné bukové lesy, javorovo-bukové horské lesy) alebo smrek (smrekové vysokobylinné). Vo výraznejších dolinkách, na sutinách a v javorovo-bukových lesoch je vyššie zastúpenie javora horského, iba zriedkavejšie sa vyskytuje jedľa, brest horský, v smrečinách sa uplatňuje aj jarabina vtáčia. Za pozornosť stojí reliktný výskyt kosodreviny na skalkách a strmých svahoch tesne pod vrcholom Skalnej alpy. Skaly a skalné steny na južných svahoch kóty Tmavá vytvárajú špecifické podmienky, na ktoré sú viazané reliktné borovicové a smrekovcové lesy charakter ktorých určuje najmä borovica so smrekom, vyskytuje sa tu aj niekoľko jedincov tisu. Zaujímavosťou lokality je pomerne výrazná zmena drevinového zloženia v závislosti od expozície svahu ako aj pestrá štruktúra porastov. Skalná alpa je významnou lokalitou horskej flóry s výskytom veľkého počtu vzácnych, reliktných a ohrozených taxónov. Relatívna odľahlosť a zachovalosť územia vytvára veľmi dobré existenčné podmienky aj pre vzácne a na vyrušovanie citlivé druhy fauny (veľké mäsožravce, kurovité, sovy, sokolovité). Prevažná časť lokality je územne chránená od roku 1964 (štátna prírodná rezervácia), v súčasnosti Národná prírodná rezervácia Skalná alpa v najprísnejšom stupni ochrany zaberá 524,55 ha, pričom zahŕňa tak lesné ako aj nelesné spoločenstvá. Celová výmera pralesa v tejto lokalite je takmer 250 ha. NPR aj spolu so širším okolím je súčasťou územia európskeho významu SKUEV0238 Veľká Fatra a Národného parku Veľká Fatra.
Skalná Alpa NPR (fotené 12.12.2013)