Au début du XX è siècle, la forte poussée démographique et l'essor toujours grandissant du protestantisme à Lesconil, amène le diocèse à envisager la création d'une église catholique près du port. Le recteur de Plobannalec, M. Guillou, prend alors les choses en main et, d'après les plans du chanoine Abgrall, une chapelle est construite en 1902, sous le vocable de Sainte-Anne.
L' édifice est assez sobre, de forme rectangulaire, avec un campanile de trois cloches. Elle ne contient aucune statue ancienne. Les vitraux viennent des ateliers Fournier, Gesta et Le Bihan Saluden. On peut remarquer que les créateurs de ces vitraux se sont permis quelques audaces, représentant une scène de l'enfance de la vierge Marie à Lesconil, et imaginant une scène de tempête apaisée au large du phare de Penmarc'h.