Furesø er Danmarks dybeste sø. Den hed oprindeligt Fuursø, fra fuur, det gamle navn for træarten fyr. Den er en del af Mølleå-systemet, samt den største sø i dette system. Søen tilføres vand fra Mølleåen, som udspringer i afløbet fra Bastrup sø og løber gennem Farum sø, før den kommer ind i Furesø ved Fiskebæk og løber ud ved Frederiksdal, og videre til Lyngby sø og Bagsværd sø, før den efter 40 km ender i Øresund. Desuden tilføres vand til Furesø via en kanal fra Vejlesø.
Dybdemæssigt er Furesø delt i to områder. Står man ved cachen og ser ud over søen ser man til venstre hovedbassinet med en gennemsnitlig dybde på 16,5 m. Søbunden i hovedbassinet er meget kuperet med skrænter, der visse steder går 20 meter lodret ned i dybet, og de dybeste huller er 38 m dybe. Til højre er Store Kalv, som er væsentlig mere lavvandet med en gennemsnitlig dybde på 2,5 m.
Furesøen er en del af et udstrakt tunneldalsystem, som blev dannet af floder, da istidens kalot smeltede for 10.000 – 12.000 år siden. Et enormt vandtryk nærmest spulede store huller i undergrunden. Det er bemærkelsesværdigt, at vandretningen dengang var den modsatte af i dag, idet isranden stod mod vest.
Furesø ejes af Miljøministeriet og administreres af Naturstyrelsens lokale enhed i Østsjælland.