O Arroio Segredo é um dos muitos córregos que se formam no alto da Serra Geral. O solo da região funciona como uma imensa esponja que absorve as águas das chuvas e vai liberando-as lentamente, dando origem a diversos olhos d'água que, unindo-se nas partes mais baixas do relevo, acabam formando córregos e arroios.
A água que corre no Arroio Segredo forma a Cascata do Tigre Preto e participa ativamente dos processos de erosão que continuamente aumentam os cânions da Serra Geral.