Courtenay est située à 26 km au nord-est de Montargis et à 26 km au sud-ouest de Sens, Gâtinais. La commune est mitoyenne de l'Yonne et de la Bourgogne sur sa limite est, qu'elle partage avec Piffonds, Saint-Martin-d'Ordon et Saint-Loup-d'Ordon. Elle est arrosée par la Cléry ou Clairis.
Hydrographie
La Cléry2 traverse la commune d'est en ouest. À son arrivée sur la commune elle s'appelle la Clairis ; elle prend naissance aux Brouards sur la commune d'Égriselles-le-Bocage au nord, passe par Vernoy et Savigny-sur-Clairis et devient la Clairie puis la Cléry en amont de Courtenay pour certains, après Chantecoq pour d'autres (voir Clairis).
Une série d'étangs se trouve dans le sud de la commune, la plupart situés sur le cours des deux branches sources du ru des Haies de la Ville3. Commençant vers le sud-est, la Courtoiserie et la Jacqueminière ensemble comptent plus d'une dizaine d'étangs dont le plus grand fait environ 5,8 ha, les autres de 3,8 ha, 3,5 ha, 3,3 ha, 1,8 ha, 1,3 ha, 1,1 ha, et quelque cinq ou six petites surfaces d'eau autour. Le tout s'écoule vers l'ouest et vers les Milons (une mare), les Pierres (une mare), le lieu-dit le Fournil (un étang de 1,4 hectare) et la Genèterie (deux mares). L'autre branche de ce ru commence à l'étang de la Râperie (3,5 hectares) entre Vaultin et le Petit Vaulfin, à l'est de la D 34 vers Villefranche ; elle va ensuite à l'étang de la Mûre (1,03 hectare), un petit étang non nommé de 65 ares, l'étang des Quatre-Cents-Ans (91 ares additionnés de 2,5 hectares de terrains marécageux essentiellement autour de sa partie sud), l'étang de Brinvillers (1,93 hectare, sur le côté est de la D 162 vers Triguères) et l'étang du Batardeau (plus de 2 hectares à 200 mètres en aval, côté ouest de la même route). Les deux branches se rejoignent vers la Genèterie et le ru des Haies de la Ville se dirige vers le nord et la Clairis. Il fait un rapide passage sur Saint-Hilaire-les-Andrésis avant de confluer avec la Cléry sur Courtenay en aval du bourg.
D'autres étangs sont présents dans le sud-est de la commune. L'étang des Buttes précède celui du Sabot sur le cours du ru de Sainte-Anne ou ru du Pont de Pierre, affluent en rive droite du ru de Piffonds. L'étang des Ramoneux fait suite à l'étang de la Ronsardière, ce dernier sur la commune de Piffonds, et contribue aussi au ru de Sainte-Anne.
Les fermes possédant une mare en plus de leur puits sont très nombreuses sur la commune.
Voies de communication
Réseau routier principal de la commune de Courtenay (avec indication du trafic routier 2014).
La section Artenay-Courtenay de l'autoroute A19 traverse la commune dans une direction plus ou moins est-ouest, avec les sorties nos 3 et 4 de part et d'autre de Courtenay (le passage par l'autoroute entre ces deux sorties est gratuit pour éviter d'encombrer le centre ville). La sortie no 3, au nord-est du bourg, jouxte l'échangeur de Courtenay entre l'autoroute A6 et la Autoroute française A19 (section Artenay-Courtenay), échangeur dont une petite partie se trouve sur la commune mais dont l'essentiel est sur Piffonds et en moindre mesure sur Savigny-sur-Clairis. Mise en service en 2009, la A19 a fait l'objet d'études préventives poussées qui ont permis la découverte de nombreux sites préhistoriques dont un site répertorié à Courtenay.
La route départementale 2060, ancienne route nationale N 60 Orléans – Sens dessert aussi Montargis à l'ouest. À son passage sur la commune, elle emprunte le trajet de la section gratuite de la A19 qui évite le passage par le bourg.
Les départementales sont plus utilisées par les curtiniens :
- Vers l'ouest, la RD32 suit le cours de la Cléry jusqu'à Ferrières et dessert Saint-Hilaire, Chantecoq, Courtemaux, La Selle-sur-le-Bied et Griselles. Vers l'est elle devient la RD107 en passant dans l'Yonne et dessert Saint-Martin-d'Ordon, Verlin et Saint-Julien-du-Sault. Elle traverse le bourg dans le sens de la longueur, faisant partie de la place Armand-Chesneau où se déroule le marché hebdomadaire très animé.
- La RD34 dessert Montcorbon et Douchy au sud ; dans l'autre direction elle emprunte d'abord le trajet de la RD32 jusqu'après Saint-Hilaire, puis remonte vers le nord et vers Ervauville, Rozoy-le-Vieil et Égreville.
- La RD232 devient la RD15 dans l'Yonne et dessert Piffonds, Bussy-le-Repos et Villeneuve-sur-Yonne.
- La RD180 va à Cudot au sud-est, et la RD162 à Triguères au sud.
Les chemins vicinaux forment un réseau dense pour desservir les nombreux hameaux, fermes, lotissements et lieux-dits.
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