Le premier château de Bienassis était un manoir du xiie siècle cerné d´une douve propriété de la famille de La Motte, les seigneurs de La Motte d´Erquy semble-t-il. Jean de Quelennec, seigneur de Quelennec en Quintin, qui épouse Tiphaine du Fou en 1374 acquiert la terre de Bienassis. Son fils Geofroy de Quelennec fait construire le logis vers 1434, date à laquelle le manoir neuf est attesté. En 13413, dans un texte relatif au manoir il est signalé comme : « une vieille salle de l'ancienne faczon fondée sur post de boays (poteaux) en manière de cohue (de halle) ».
Il a été occupé par les troupes du duc de Mercœur pendant les guerres de la Ligue à la fin du xvie siècle, en partie détruit et reconstruit à dater de 1620 par Gilles Visdelou seigneur de La Goublaye en Saint-Alban, et son épouse Françoise de Quelennec. Il passe par mariage au comte de Lambarc et au duc d’Arenberg, puis, en 1760, le château est vendu à François-Louis Visdelou de la Ville-Théart, commissaire des haras de Bretagne. À cette époque, le domaine comprend 39 métairies, 7 moulins, et s’étend sur plus de 1000 hectares. Confisqué pendant la Révolution, il servira de prison.
En 1796, il est acheté par le général Jean Valletaux, général français de la Révolution, puis général d'Empire et député des Côtes-du-Nord.
En 1880, la famille Le Pomellec, ses descendants, le vendent à l’amiral Jules de Kerjégu, grand navigateur. Il s’y installe après avoir participé à toutes les grandes campagnes de son siècle : expéditions du Mexique, de Crimée, Chine et Cochinchine.Ce chateau est aujourd'hui toujours propriété de la famille de Kerjégu.
Le château de Biennassis, son grand escalier, la poterne d'entrée, le jardin et l'allée ont été classés monument historique le 29 août 1945. Ce classement est remplacé par un autre classement en 2012, lui-même remplacé par un classement plus général le 25 avril 2013.