Nedávno bol objavený a popísaný nový gén, ktorý sa podieľa na úspešnosti kešera riešiť mystery kešky. Tento gén dostal názov mysteriolyzín. Kompletná sekvencia tohto génu obsiahnutého v jadre bunky ľudí schopných riešiť mystery kešky vám prinášame aj v tomto listingu. Gén má svoj lokus na 19. chromozóme. Keď sa aktivizuje jeho expresia, tak sa podieľa na novo popísanom mechanizme nazvanom mysteriolýza. Jeho proteínový produkt využíva hydrolýzu disulfidických väzieb medzi aminokyselinami cysteínu v proteíne génu mysteryn (Mys2). Táto lýza vyvolá zmenu konformácie molekuly proteínu mysteryn a otvorí sa tak jej reakčné centrum. Transkripcia mysteriolyzínu prebieha prevažne v nervových bunkách neokortexu. Bolo dokázané, že dokonca aj nízke koncentrácie mysteriolyzínu zvyšujú percento úspešne vyriešených mystery kešiek u organizmu H. sapiens poddruh geocacherins. Avšak spôsob ako funguje proteín mysteryn zostáva stále neznáma a vyžaduje si ďalší výskum.
No a práve tento gén je kľúčom pre vyriešenie tejto kešky. Ďalší level série GEO-genetika 5 rozvíja ten predchádzajúci level. Preto sa so základnou teóriou môžete oboznámiť v listingu GEO-genetika - level 4. Obtiažnosť sa skrýva v zadaní údajov, ktoré sú naformátované do formátu FASTA, ktorý používajú genetici pri analýzach a porovnávaní génov a proteínov pomocou softvéru.
Na vyriešenie totho levelu však nepotrebujete nič inštalovať ani hľadať špeciálne skripty spracúvajuce FASTA. Stačí pochopiť niekoľko genetických pojmov: RNA SPLICING, EXÓN, INTRÓN, ČÍTACÍ RÁMEC (reading frame). Potom môžete použiť niektoré dostupné skripty pre transkripciu a transláciu a pozorne vyhodnotiť výsledky. Takže zapnite expresiu mysteriolyzínu v tých malých šedých bunkách mozgovej kôry a hor sa študovať a riešiť!
Homo sapiens mutated Mysteriolysin (Mly1) gene, complete CDS
GenBank: gc8bfkx.1
FASTA
| LOCUS |
gc8bfkx 1835 bp DNA linear PRI 01-AUG-2019 |
| DEFINITION |
Homo sapiens geocacherins cache domain containing (Mly1) [Homo sapiens ssp. geocacherins], DNA |
| ACCESSION |
gc8bfkx |
| VERSION |
gc8bfkx.1 |
| KEYWORDS |
mysteriolysin, from dna, to rna, to protein, transcription, translation |
| SORUCE |
Homo sapiens geocacherins (mostly human) |
| ORGANISM |
Homo sapiens
Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
Catarrhini; Hominidae; Homo; spaiens; geocacherins |
| REFERENCE |
1 |
| AUTHORS |
Msim, M. J. |
| TITLE |
GEO-genetics 5: New protein discribed (mysteriolysin) included in the mystery caches solving proces. |
| JOURNAL |
West Carpathians Geocaching Research 1 (25), 154-159 (2019) |
| GeoPUBMED |
25088701 |
| COMMENT |
After SastRe,O. und Engel, G.(2016) discovery of protein mysteryn (Mys) this is the second known protein involved in mysteriolysis. Mysteriolysis is the newly described mechanism how the protein mysteryn is activated. Newly described protein uses hydrolysis of disulfidic bonds in mysteryn protein cystein aminoacids. This causes the conformation change of mysteryn protein and opens its reaction center. Mysteriolysin is mostly transcribed in neocortex neuron cells. Even low concentrations of this mysteriolysin protein have been proven to increase the percentage of succesfully solved Mystery caches in the organism H. sapiens ssp. geocacherins. However the mechanism how the protein mysteryn works still remains unknown and further studies are needed. |
| FEATURES |
|
| source |
1..1835
/organism="Homo sapiens geocacherins"
/mol_type="genomic DNA"
/db_xref="taxon:9606"
/chromosome="19"
|
| gene |
70..1835
/gene="gMly1"
/protein="Mly1"
/note="Mysteriolysin protein"
|
| intron |
196..288
/gene="gMly1"
|
| intron |
523..600
/gene="gMly1"
|
| intron |
700..843
/gene="gMly1"
|
| intron |
1108..1195
/gene="gMly1"
|
| intron |
1316..1405
/gene="gMly1"
|
| intron |
1540..1724
/gene="gMly1"
|
| intron |
525..549
/gene="gMly1"
|
ORIGIN
1 gtagtctctc tttgactcgc atcgtcagtc gtccactcca tctcacccca ttcacccacc
61 tcccctcagc cccagagcaa gctggccgac gccaccccca ggcagaccga gatcaacgtg
121 gaggtgaagg ccaggtacca gacccaggtg aacatcgagt acgagaccgc caaggagctg
181 gcccacaagg aggccgtgag ctcaggcagc atgactcacc accacagtgt gacccagtca
241 gtcgcgatcc cccaaggtga cgatcagtcc tcatccctca ccctccagct ggagaaggag
301 gacacccaga cccagtgcat caccgccagc accgccaaga gcgccaccca gccccaggac
361 gccaggatcc tgcaggccgt gagcgagacc aagtacatca acaccaggca gaactacagc
421 atcgtgagcc ccgagagcaa cgaggtgtac agcaccatcg agcccatcct gaccgccaag
481 accatcatgc agtgcgagat gcccagggag tgcagggccg acgtgagagg agacgaggac
541 ttagcaggat gtccacaacg agtgagcgga gggatacatc tcccctcctg cacttctcag
601 atcaccgtgc tgcagtgcga gaacatcgag aaggagagca agtactacga ggtgctgcag
661 tgcgagaacg ccaacgccag cgaggtggag aggagcaccg tgagacagac ccattagcag
721 tcatcatcaa caccaggaga gcagagctaa tgcaacaccc acacacgttg gaccacacga
781 gacgacgtgc taacaatcca tcagccacac acaaaacaca cttggaaagc tcccaccctc
841 cagtacagga tccagagcga gatgagcacc gtgcccaacc aggtgagcac ctacaggatc
901 accaggatct gcatcgccag gaaggccacc aggatcagcg aggacgagat ggacgtggcc
961 atgatcaacg tgaccgccgt gtactgccac caggacaacg tgctggccta cgaggacgag
1021 aaccagagcg agatgagcac cgtgcccaac caggtgacca ggatccagag cgagatgtgc
1081 atcgccagga aggccagcac ctacagggtg agggagcagg gagaaaaccc catggatatg
1141 gagtgtaggg ggagacgtga gggacagcac gcagggcctc cctcgttccc ctcagatcga
1201 cgaggtggcc accgacgtgg ccatgatcaa cgtgacctgc caccaggacg accagtgcat
1261 cggcctggcc aacgccgacc agctgaacta caagcagaac atcgagtgcc aggacgtgag
1321 aacgacggac gggagcagaa tttgcagttc agaatattta tataatttac acccgtcggg
1381 tgatcacgcc ttctcactcc cccagaccat cgccctgccc cagtgcgccg gccagctgtt
1441 ccaggtggag atccacagga tcagcaagca ggaccagcac cagaggtaca acgcctacga
1501 cgagagctac gtgccccagg actgcgtgat cagcctgcag gtgagcaccg tgagacacca
1561 cattacacac agggggacaa aaaccacaga ggtatcgtcg tctcgggacg gcgggattca
1621 aaaacagagg aagaaaggga gacagaggtc tcagatctcc tgcgggacgc aaacgtacca
1681 tattcattac tgattgatgt gaaactcgca cctgtcccct ccaggagaac caggtgatgc
1741 agcacgtgac caacgagtac agcaaggccc tgtaccccag ggcctacgag atgcccagga
1801 tctacgagat gaactaccag gacctgcagg tgtag
Táto keška je súčasťou série 9+1 kešiek, každá nasledujúca má stúpajúcu obtiažnosť od 1 do 5. Dúfam, že budú pre vás zdrojom zábavy i poučenia.
V každej z nich sa nachádza kartička, na ktorej sú atómy alebo skupiny atómov. Poskladajte z nich molekulu a dokážete vyriešiť BONUSovú cache.
Vzhľadom na to, že keška v septembri 2020 zmizla, obnovil som ju asi o 2 metre vedľa, pozrite pridaný fotohint.