Das "Secret Sewer Lair" (dt. "Geheime Kanalhöhle") ist das Geheimversteck der Turtles und befindet sich in einer verlassenen U-Bahnstation unterhalb von Chinatown, New York City und ist in vielen Episoden zu sehen. Das Versteck ist mit einer Küche, einem Wohnzimmer mit Fernseher, Schlafzimmern für die Turtles und Master Splinter, sowie einem Dojo zum Üben von Ninjutsu ausgestattet. Außerdem gibt es in der geräumigen Höhle eine Werkstatt für Donnie und einen Meditationsraum für Master Splinter. Sie ist sogar ans Stromnetz angeschlossen, um die Lichter sowie Donnies Elektro-Tools mit Strom zu versorgen und damit die Turtles Video-Games spielen können ;) Obwohl das Versteck sich in der Kanalisation befindet, scheint die Höhle bequem genug zu sein, dass Besucher wie April und Casey nicht davon abgeschreckt zu sein scheinen. Eure Aufgabe: Findet den Zugang zum "Secret Sewer Lair"! Dort haben Leonardo, Donatello, Michelangelo, Raphael und Meister Splinter einen Cache für euch versteckt. Cowabunga!