Gegründet wurde die Kapelle in der Nähe einer Quelle, die schon zu heidnischer Zeit wegen vermeintlicher Heilkraft aufgesucht wurde.
Die Rupertuskapelle ist eine nach dem Bischof Rupert von Salzburg benannte evang.-luth. Kirche.
Diese soll um 1080 vom Bamberger Bischof Rupert errichtet worden sein, womit sie eines der ältestenKirchengebäude in dieser Gegend wäre.
1710 wurde unter Markgraf Christian Ernst das Kirchenschiff erweitert und mit einem Zwiebelturm versehen. Um die Kirche ist eine Mauer, die Hinweis gibt, dass hier mal ein Friedhof war.
In den Sommermonaten finden hier am Samstagabend Gottesdienste der evang.-luth. Kirchengemeinde St. Jakob Obernsees statt.
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