Kupiškio parapinė mokykla pirmą kartą paminėta 1678 m. klebono Jono Krukovskio sudarytame bažnyčios inventoriaus sąraše. Čia mokėsi būsimasis garsus architektas Laurynas Gucevičius.
1917 m. Kupiškio parapijos klebonas Antanas Bajorinas ir kamendorius (vikaras) Antanas Kripaitis padavė prašymą vokiečių okupacinės valdžios vyriausiajam Lietuvos valdytojui dėl leidimo įsteigti Kupiškyje aukštesnę mokyklą, pagal gimnazijos 4 klasių programą. Tais pačiais metais gautas leidimas įkurti keturių klasių progimnaziją jau kitoje vietoje
The Kupiškis parish school was first mentioned in 1678 in the church inventory list compiled by pastor Jonas Krukovskis. The future famous architect Laurynas Gucevičius studied here.
In 1917, the pastor of the Kupiškis parish, Antanas Bajorinas, and the chaplain (vicar) Antanas Kripaitis submitted a request to the Supreme Governor of Lithuania of the German occupation authorities for permission to establish a higher school in Kupiškis, according to the 4-grade gymnasium program. In the same year, permission was received to establish a four-grade progymnasium in a different location