Les communes d'Ozouer-le-Repos et d'Aubepierre, instituées par la Révolution française, fusionnent en 1973 en application de la loi sur les fusions et regroupements de communes de 1971 (Loi Marcellin), formant la commune actuelle d'Aubepierre-Ozouer-le-Repos.
Aubepierre avait elle-même absorbé Pecqueux en 1839.
Du 25 au 29 décembre 1999, des inondations, des coulées de boue et mouvements de terrain sont ressentis, conséquences de la tempête de 1999.
