GCVP0G Biologische Forschungen - Teil 1 (Unknown Cache) in Nordrhein-Westfalen, Germany created by Wild Cards

GCVP0G ▼

A cache by Wild Cards Message this owner

Hidden : 4/26/2006

Difficulty:

Terrain:

Size: Size: small (small)

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Geocache Description:

Wichtiger Hinweis: Der Weg zum Cache ist auch für Kinder geeignet.
Die Dose selbst ist aber nur nach einer (kurzen) Kletterpartie zu erreichen. Hier gilt also besondere Vorsicht. Dass Ihr auf eigene Gefahr auf Dosensuche geht, wisst Ihr ja eh. ;-)
Die Startkoordinaten geben nur eine grobe Orientierung. Der Cache liegt NICHT im Baldeneysee! ;-)

Update 13.12.2006:
Neu eingefügte Hilfestellungen zur Lösung sind am Ende der Beschreibung zu finden.

Und nun zur heutigen Folge unseres "Telekolleg Biologie: Polymerase-Kettenraktion (PCR)"

Cryptococcus neoformans dient als exzellenter Modellorganismus für Studien von biologischen Prozessen pathogener Pilze. Dieser weltweit verbreitete, zu den Basidiomyceten gehörige Hefepilz hat vor allem innerhalb der letzten zwei Dekaden im Zusammenhang mit AIDS, Chemotherapien bei Krebsbehandlungen sowie Immunosuppressionen nach Organtransplantationen an Bedeutung als Humanpathogen zugenommen.

Infektionen beginnen nach Inhalation von kleinen Hefezellen oder Sporen in den Lungenbläschen. Der Organismus breitet sich sodann über die Blutbahn zu den anderen Organen, im Besonderen zum Zentralen Nervensystem, hin aus. Dort induziert er vermutlich die Produktion von Neurotransmittern, welche sein Überleben sichern. Die Infektion mit Cryptococcus gilt nach derzeitigem Stand der Forschung als Hauptursache für Meningoencephalitis, welche unbehandelt zum Tod durch Atemstillstand führt.

Es ist weithin bekannt, dass Pheromonen bei der Partnererkennung und damit verbunden auch der Fortpflanzung bei Säugern eine nicht unbeträchtliche Rolle spielen. Zum Erstaunen vieler Nicht-Fachleute wurde Pheromone nicht nur bei diesen „höheren Tieren“ und Insekten sondern auch bei einigen Pilzen nachgewiesen. So stellt MFA1 ein Pheromongen von Cryptococcus neoformans da. Um ein tieferes Verständnis über den Lebenszyklus von Cryptococcus zu erhalten und ggf. Ansatzpunkte für pharmakologische Behandlungen einer Infektion mit diesem Humanpathogen zu ermöglichen sind wir auf Ihre Mithilfe angewiesen. McClelland et al. ist es gelungen, die MFA1-Sequenz zu entschlüsseln. Mittlerweile ist es dank der ausgezeichneten Recherche von unseren Kollegen aus dem GC-Labor endlich gelungen, diese 2108 Basenpaar-Sequenz aufzutreiben und uns für die weitere Arbeit online in der größten biotechnologischen Datenbank eingetragen zur Verfügung zu stellen. Ferner ist es heute Nacht einigen Forschern aus unserem Team endlich gelungen, Gesamt DNA aus Cryptococcus neoformans aufzuarbeiten. Verwenden sie die Primer mfa1_forward und mfa1_reverse um das MFA1-Gen zu amplifizieren.

Sobald Sie das PCR-Produkt erhalten haben, bestimmen Sie die Anzahl der Basenpaare (x).
Dies ist für die weiteren Versuche essentiell!

Der Versuch ist abgeschlossen, wenn Sie Ihre Versuchsbeobachtungen im Laborbuch eintragen.
Diese finden Sie an folgenden Koordinaten:

N 51° 24. (x-117)

E 007° 01. (x + 238)

Der Empfang ist in der Nähe des Caches nicht optimal. Achtet deshalb auf Hint und Spoilerfoto.

Die weitere Forschung steht und fällt mit Ihrem Erfolg!

mfa1_forward: 5'-tca cta tgg tca ttt gcg cg-3'

mfa1_reverse: 5'-aaa ggc aat ata tat cca gat a-3'

Erstinhalt des Caches:

Logbuch (bleibt im Cache)
Hinweis für Zufallsfinder (bleibt im Cache)
1 Minibuch
1 Schlüsselanhänger
1 Jojo
1 Button
1 Packung Buntstifte
1 Olympiamaskottchen
Eppis in verschiedenen Größen und Farben

TB "Sensenschlumpf"

Viel Erfolg wünschen

Die Wild Cards

P.S. Uns ist klar, daß diese Rätsel nicht gerade einfach ist (daher ja auch die 4 Sterne *g*), aber dennoch ist die Lösung auch für Nicht-Fachleute durch eine guten Portion Kombinationsgabe (Hinweise und Animationslink beachten!) zu finden. Ansonsten stehen wir wir natürlich auch mit Hilfestellungen und weiteren Tipps zur Verfügung.

An dieser Stelle noch ein paar Erläuterungen, die zur Lösung des Rätsels beitragen.

Die Bezeichnungen forward bzw. reverse bei den beiden mfa1-Primern geben die Lese- bzw. Syntheserichtung an. Das bedeutet:

- Der forwar-Primer bindet am Gegenstrang. Daher ist die Basenfolge für den forward Primer ist exakt der zu ermittelnden Nukleotid-Seqeunz zu entnehmen.

- Der reverse-Primer bindet an dem Strang, dessen Sequenz unsere Kollegen uns freundlicherweise überlassen haben (s.o.). Daher müssen hier zwei Dinge bedacht werden:
1. Die Leserichtung ist umgekehrt (also von rechts nach links).
2. In der angegebenen mfa1-Seuqenz sind nur die komplementären Basen und nicht die reverse-Primer-Sequenz selbst angegeben!
Eine schöne (und sicher SEHR HILFREICHE) Animation, welche das Prinzip der Polymerase-Kettenreaktion (PCR) erklärt, ist auf folgender Seite zu finden:

PCR-Animation
Die folgende Abbildung ist als weitere Hilfe zum Verständnis gedacht:

Additional Hints ()

mhz Eägfry: Onfrasbytr orvqre Cevzre va qre ireyvaxgra Frdhram fhpura (süe zsn1_erirefr vfg qvrfr nagvcnenyyry, fcevpu xbzcyrzragäer Onfra haq Yrfrevpughat iba erpugf anpu yvaxf). mhz Irefgrpx: Va qre Aäur qrf Pnpurf svaqrg Vue rvar teüar Rvaevpughat, qvr na rvara yvarnevfvregra Qbccryfgenat revaareg. Oyvpxg va Evpughat 345 Tenq.

Decryption Key

A|B|C|D|E|F|G|H|I|J|K|L|M
-------------------------
N|O|P|Q|R|S|T|U|V|W|X|Y|Z

(letter above equals below, and vice versa)