Pieni Lokkisaari vajaan puolen kilometrin päässä Kärnänsaaren itärannasta on koko järven paras paikka kärnäiitin ihmettelemiseen. Aikaisempien vuosikymmenien kävijät ovat keränneet talteen lähes kaikki kuivalla maalla olleet maakuntakivet, mutta vesirajan tuntumassa on suuri kärnäiittien mosaiikki.
Lappajärven kärnäiitti, kutsutaan myös nimellä impaktiitti, on impaktilaavaa, joka on syntynyt nopeasti törmäyskohdan sulaneesta kallioperästä, graniitista ja gneissistä. Sulaan on sekoittunut muita sulamatta jääneitä kivenpalasia ja mineraalisiruja, pääasiassa kvartsia. Kärnäiitti sisältää myös hieman törmänneen kappaleen aineksia, esimerkiksi iridiumia.
Kärnäiitti muistuttaa hyvin paljon laavakiveä. Kiven murtopinta on sinisen musta ja rapautumispinta on harmaa. Rantakivikosta löydetyssä kärnäiitissä on ohut, ruskean musta rautapitoinen pinta ja pinnassa on myös kivelle tyypillisiä aallokon kuluttamia pieniä koloja. Nimensä se sai löytymispaikkansa Kärnänsaaren mukaan ja se on myös nimetty Etelä-Pohjanmaan maakuntakiveksi.