Klub piłkarski powstał w 1945 r. Pierwszy oficjalny mecz rozegrano 28 sierpnia w 1945 r. z drużyną Lotników Armii Czerwonej stacjonującej wówczas w pobliskich Pyrzycach. W listopadzie tego samego roku odbyło się zebranie założycielskie, podczas którego przyjęto nazwę Klub Sportowy Witnica. Pierwszym prezesem klubu został Pan Wacław Drzewicki.
Historia klubu to gra w niemal wszystkich klasach rozgrywkowych. Największy sukces klub odniósł w sezonie 1965/66 kiedy to ówcześni „Czarni” grali w II Lidze. Było to jedyne tak spektakularne osiągnięcie, w następnych latach niestety wyniki były coraz słabsze. Po wielu sezonach tułaczki w niższych klasach w 1993 r. udało się awansować do okręgówki. W tym okresie przyjęto w nazwie drugi człon „Browar”.
Klub "Czarni-Browar Witnica" jest użytkownikiem nowoczesnego stadionu piłkarskiego, na którym odbywają się treningi oraz mecze. W sezonie zimowym młodzi piłkarze trenują w nowoczesnej hali oddanej do użytku w 1999 roku. Stadion wyposażony jest w kompleks odnowy biologicznej, z którego korzystać mogą również i mieszkańcy miasta.