Die Warme entspringt in den Hinterhabichtswälder Kuppen in der Gemeinde Schauenburg bei Martinhagen. Ihre Quelle liegt im Naturpark Habichtswald am Osthang des Wattenberges (516,2 m ü. NHN) auf etwa 414 m[1][2] Höhe. Nach ihrem kurzen Quelllauf in Richtung Osten fließt die Warme im Habichtswälder Bergland, einem Teil des Westhessischen Berglands, in Richtung Norden durch die landwirtschaftlich genutzte Habichtswälder Senke. Darin steuert sie östlich an den Hinterhabichtswälder Kuppen mit dem Großen Bärenberg (600,7 m) sowie jeweils westlich am Hohen Habichtswald mit dem Hohen Gras (614,8 m) und dem etwas nördlich davon gelegenen Naturraum Dörnberg und Schreckenberge mit dem Hohen Dörnberg (578,7 m) vorbei. Dabei passiert sie in der Habichtswälder Senke Ehlen direkt westlich und das zu diesem Dorf gehörende Gut Bodenhausen östlich und durchfließt nach Unterqueren des Warmetalviadukts der Bahnstrecke Volkmarsen–Vellmar-Obervellmar die Kernstadt von Zierenberg. Nördlich Zierenbergs verengt sich die Habichtswälder Senke allmählich, und die Warme fließt dort erst östlich des Hinterhabichtswälder Kuppen und westlich des Naturraums Dörnberg und Schreckenberge im Osten und dann im Malsburger Wald vorbei am ehemaligen Gut Rangen und dem Hof Strippelmann und durch die nördlichen Zierenberger Ortsteile Laar (mit dem Schloss Laar) und Hohenborn. Danach verlässt sie das Westhessische Bergland und den Naturpark Habichtswald etwa 1 km nordöstlich Hohenborns. Im Unterlauf durch die zum Niedersächsischen Bergland gehörigen Beverplatten fließt die Warme durch ein breites Tal zwischen Ober- und Niedermeiser, wobei bei Obermeiser die von Südosten heran fließende Nebelbeeke und nahe der an der Warme stehenden Fuchsmühle bei Niedermeiser der von Westen kommende Ruhrbach einmündet. Weiter nördlich fließt die Warme durch Zwergen, um nach anschließendem Unterqueren der Landesstraße 3210 (Liebenau–Ostheim) und der Bahnstrecke Kassel–Warburg auf rund 140 m[1][2] Höhe in die dort von Südwesten kommende Diemel zu münden; etwa 150 m westlich ihrer Mündung steht an der Diemel die zu Liebenau gehörende Hünscheburg.