La Escuela de Náutica, ubicada en los límites entre Santurtzi y Portugalete, en un edificio diseñado por los arquitectos José López Zanón y Luis Laorga Gutiérrez e inaugurado el 14 de diciembre de 1968, se denominó durante un tiempo Escuela Superior de la Marina Civil de Bilbao Leopoldo Boado, en homenaje a Leopoldo Boado Suances, desde 1994 es un centro de la Universidad del País Vasco, denominándose Escuela Técnica Superior de Náutica y Máquinas Navales desde 1999.
El primer director fue el santurzano Gaspar Aspiazu Mañas, hijo de Zenón Aspiazu.
En 1919 o 1920 Leopoldo Boado fue sustituido por Florentino Pérez Villarejo. Bajo la dirección de este último ejercieron como profesores Daniel Camio Causo (astronomía y navegación), Guillermo Azcoitia Muesca (inglés) y Robertson (legislación marítima).
Un informe redactado en 1920 por Leopoldo Boado, recién nombrado director de la Escuela de Náutica de Bilbao, en el que valora muy negativamente la enseñanza impartida en Santurtzi nos facilita más información de nuestra escuela. Señala que el personal docente de la escuela se reduce a tres profesores. La dirige un licenciado en Letras (quiero suponer que es Florentino Pérez) que se ve obligado a impartir Ciencias Físicas, Matemáticas, Mecánica y Máquinas, Geografía e Historia. Completan el reducidísimo cuadro de profesores un capitán de la Marina Mercante (Daniel Camio), que imparte Enseñanzas profesionales, Dibujo, Geometría e Higiene, y un profesor mercantil que imparte inglés y legislación.
La Escuela se trasladó a su emplazamiento actual, en Portugalete, durante el curso 1968-69 siendo director Gaspar Aspiazu. En 1975, la carrera de Náutica pasó al rango de Enseñanza Superior y en 1994, quedó integrada en la Universidad del País Vasco/ E.H.U.
La escuela, esta varada firmemente y anclada sobre la antigua playa de Portugalete, que se situaba entre Peñota y el Muelle de Hierro de Portugalete. La silueta y fisonomía de la súper-estructura de la nueva escuela, simboliza un moderno trasatlántico, varado sin escora alguna, sobre este bello mojón de Portugalete-Santurce. Sorprende su volumen arquitectónico y su referencia naval, para uso universitario, con una obra viva de monolítica construcción, semejando un casco de hormigón visto, con un bien estudiado coeficiente de afinamiento y francobordo, y con ocho escobenes, sobre las amuradas de babor y estribor.
Su superestructura superior de cara al mar, a barlovento del viento dominante del Mar Cantábrico, lo forman cuatro puentes principales y dos auxiliares, edificados con modernos elementos estructurales de aluminio, con sólidos paramentos en claros tonos y matices; que dan a las fachadas exterior un aspecto de Universidad. Pasando a su interior nos encontramos primeramente con amplias estancias bajeras a modo de espaciosas bodegas, con gran manga, eslora y calado, donde los baos son reemplazados por jácenas o vigas, y las cuadernas por sólidos pilares de hormigón armado. Subiendo por la escalera principal, de cómoda y elegante hechura, nos da acceso a los cuatro entrepuentes principales, donde visitamos las diferentes cámaras. La primera es un gran salón climatizado, destinado a proyecciones y conferencias con mil plazas, verdadero anfiteatro naval, situado bajo el castillo de proa. Después las diversas aulas, y entre ellas la biblioteca, secretaría y salón de profesores; nos van dejando una grata impresión de un buen Proyecto.
Desde 2005, impulsado por el director de la Escuela, Fernando Cayuela, se viene completando una exposición de anclas y otros elementos de fondeo y amarre ubicada en el hall principal del centro y en el aparcamiento exterior.