Dworzec kolejowy w Szczytnie wybudowano w 1883 eoku, mkiey to uruchomiono pierwszą linie kolejowa łacząca szczytno z Olsztynem.W swojej historycznej postaci dworzec dotrwal do dziasiaj.W zespoloe zabudowan dworcowych znajduje sie zabytkowy budynek WC oraz wieża cisnień. Szczytno to stacja węzłowa, na której kończy się jednotorowa linia kolejowa z Ostrołęki. W przeszłości rozpoczynała się tu również linia w kierunku Biskupca Reszelskiego - obecnie jest ona nieprzejezdna, a do niedawna w rejonie stacji pozostawał niewielki fragment toru, wraz z semaforem wjazdowym. Szczytno posiada dość rozbudowany układ torowy - stanowi go 7 torów głównych, z których 4 posiadają krawędź peronową. Stanowi to dość dobitnie o znaczeniu tej stacji, która niestety zmniejszała się na przestrzeni mijających lat.
Stacja została przebudowana w ramach modernizacji linii kolejowej Olsztyn - Szczytno - Szymany. W pierwszym etapie zasadniczo nie zmieniono układu torowego, skupiając się na wymianie nawierzchni torowej części torów oraz przebudowie peronu 2. W etapie drugim dokonano likwidacji części nieużywanych torów, a niektóre rozjazdy wyłączone z eksploatacji zamknięto. Na zredukowany układ torowy zabudowano nowe, komputerowe urządzenia sterowania ruchem kolejowym, które umiejscowiono w dawnej nastawni wykonawczej "Sz1". Nastawnia ta obsługuje rogatki na 5 przejazdach kolejowych i jednym przejściu dla pieszych. Pomiędzy 1 a 2 etapem ruch pociągów prowadzony był przez nastawnie "Sz" i "Sz1", które posiadały urządzenia mechaniczne scentralizowane z sygnalizacją świetlną. W obrębie stacji znajdowała się również strażnica przejazdowa, która wraz z nastawniami obsługiwała 5 przejazdów kolejowych. Drugi etap obejmował również zabudowę rogatek na przejściu dla pieszych. Uruchomiono także LCS Szczytno, obejmujące sterowaniem stacje Marcinkowo, Pasym oraz Szymany.
Kolejne prace modernizacyjne zostały zrealizowane w latach 2018-2020 i obejmowały przebudowę peronu 1, który wykonano jednak w innym standardzie (wyższy, inna nawierzchnia) niż peron 2. Przebudowano dalszy odcinek linii w kierunku Ełku. Zasięg LCS Szczytno rozszerzono o stacje Spychowo, Pisz oraz Drygały. W przypadku samego dworca, ze względu na wartości architektoniczno-historyczne budynku, przewidziana jest ograniczona ingerencja w strukturę zewnętrzną obiektu. Polegać ona będzie na renowacji oraz odtworzeniu pierwotnego wyglądu dworca, zwłaszcza dachu. Zakres prac obejmuje zlikwidowanie barier dla osób niepełnosprawnych, zmianę układu oraz funkcji pomieszczeń, zapewnienie nowej poczekalni, holu kasowego, lokali komercyjnych, pomieszczeń gospodarczych i technicznych, wykonanie nowej identyfikacji wizualnej, systemu monitoringu. Na parterze przewidziano pięć lokali komercyjnych, w tym kasy oraz pomieszczenie dla drużyn konduktorskich. Na pierwszym piętrze przewidziano hostel z pokojami sypialnymi.