Der Börnersee entstand ab 1850 aus der Tongrube für die erste Borgsdorfer Ziegelei unweit der Birkenwerder Ziegeleien (seit 1837). Der Bedarf an Tonziegeln bestand aufgrund verheerender Ortsbrände, des Baus von Kirchen und Wasserwegen sowie des Ausbaus der Stadt Berlin. Die Ziegelei wurde ab 1890 vergrößert/modernisiert (Ringofen 1893).
Die gesteigerte Quantität/Qualität der Ziegel erforderte den Einsatz von Maschinen und Sprengstoff. Der zunehmende Wasseranfall konnte mithilfe von Pumpen (erst Windmühle, später Dampfpumpen) im Betriebsablauf direkt verwendet werden. Nach Unwettern in den Jahren 1907 und 1910 wurde die Ziegelproduktion am/im Ort endgültig aufgegeben und Produktionsgebäude nördlich der Grube bis hin zum Föhrenwinkel meist abgetragen. Die erst 1904 gebaute Privatanschluss-bahn wurde noch bis 1926 weiter betrieben.
Nach 1920 erwarb die Familie Börner (Namensgeber) den damaligen Pioniersee nebst Umgebung, zäunte alles ein und gestaltete Uferbereiche zur Erholung. Der Zugang war auf ausgewählte Anwohner beschränkt. Es gab Streuobstwiesen, einen Uferweg mit Tischen/Sitzkojen und zwei Fischteiche.