Plavební kanál slouží převážně nákladní dopravě. Lze se tu však setkat i s osobními motorovými loděmi. Od jara do podzimu můžete za 55 minut doplout pravidelnou lodní linkou od Čechova mostu do přístaviště „Praha-Troja, ZOO“, které najdete zhruba ve čtvrtině kanálu na pravém břehu. Plavba celým plavebním kanálem se dá absolvovat během delších lodních výletů, např. z Prahy do Mělníka.
Přes kanál vedou celkem tři mosty. Silniční most v ulici Za Elektrárnou slouží pro běžnou dopravní obsluhu Císařského ostrova a částečně i pro provoz Ústřední čistírny odpadních vod (ÚČOV). Je také využíván pro pěší jako spojení mezi Stromovkou a Trojou a k propojení cyklotrasy A1 na levém břehu a cyklotrasy A2 na pravém břehu Vltavy.
Jednopolový ocelový silniční most v areálu ÚČOV je určen předně pro provoz čistírny, ale je i spojením pro pěší a cyklisty mezi Císařským ostrovem a městskou částí Praha 6-Papírenskou ulicí na levém břehu kanálu. ÚČOV na protějším (pravém) břehu kanálu byla uvedena do provozu roku 1966, v 80. a 90. letech 20. století byla významně rekonstruována. ÚČOV je mechanicko-chemicko-biologická čistírna. Přitékají sem průměrně necelé 4m3/s odpadní vody. Čistírna biologicky odstraňuje uhlíkové znečištění a částečně nitrifikuje amoniakální dusík. Fosfor se z vody odstraňuje srážením železitými solemi.
Most bývalé polní dráhy byl užíván pro polní dráhu ze Staré čistírny odpadních vod. Je součástí areálu Ekotechnického muzea, které je včetně něj národní kulturní památkou. Na mostě se plánuje obnova polní dráhy o rozchodu 600 mm a její napojení na soustavu kolejišť v areálu muzea.
Vodní dílo změnilo ráz řeky v Trojské kotlině. Na opačné straně ostrova se zachovalo říční koryto s přirozeným spádem hladiny - Trojská peřej.
16. září 2011 byla u příležitosti Dne cyklistů a pěších otevřena nová část cyklostezky Papírenská, součásti trasy A1. Povrch je mlatový, bez obrubníků. Výstavba cyklostezky v délce cca 850 m stála 800 tisíc korun.
The navigation channel Troja – Podbaba
The navigation channel is a part of the three-kilometre-long water work Troja – Podbaba built between 1899 – 1902 within the overall navigation and flood control of the Vltava river. The channel lines the left side of the Imperial Island, where there is the Prague Central Sewage Treatment Plant.
Pro cestu ke keši doporučuju jít od Stromovky nebo od Nádraží Podbaba podél plavebního kanálu. Viz parkoviště. Při pěší cestě od zastávky MHD Nádraží Podbaba můžete od 12.12.2014 projít podchodem nové železniční zastávky.
Pro kačery nižší postavy je terén náročnější.